立足于广东省省情，以生物学、生态学、林学为基础，结合城乡规划学、地理学、社会学、旅游学、法学、管理学等相关学科，围绕自然生态系统保护和国家公园体制等相关重大问题和关键技术，重点开展国家公园内涵、体制、发展、建设、保障等本土化研究，积极谋求在资源保护和利用、旅游和文化发展、地方和社区进步等各领域的合作研究方式。

以广东省具有世界或国家意义的生物资源和自然遗迹为重点研究对象，重点开展南岭亚热带常绿阔叶林森林生态系统和森林景观、丹霞地质地貌典型景观及其生态系统、海岛生态系统和滨海景观（含：红树林）、内陆淡水和河口湿地生态系统和湿地景观（含：桑基鱼塘）等科学考察和科学价值评估，为保护广东省国家公园资源的原真性、完整性提供科学依据，为国家公园资源的保护和利用提供技术支撑。

以自然资源保护、生态系统修复、生物资源可持续利用为主要目标，立足于广东省的国家公园资源，重点开展资源利用方式与内容、资源利用与环境的关系、资源利用与经济发展的关系、资源利用的品质保障、限制游憩利用的范围、资源与环境管理、资源与环境保育技术等研究，科学划定功能区，编制具有前瞻性、科学性和可操作性的国家公园总体规划，并开展高水平的国家公园相关设施设计。

围绕广东省国家公园资源，发挥生态学、物理学、化学、植物学、微生物学、分子生物学、栽培学和环境工程等多学科交叉，重点开展相关生态修复目标及修复策略研究、生态修复措施与技术组合研究等，为国家公园提供切实可行的生态设计与修复方案。